W strukturze organizacyjnej ZRE Lublin S.A. funkcjonują trzy zakłady – samodzielne centra zysków – świadczące usługi dla klientów:
Zakład Lublin:
Wydział Produkcji Mechanicznej i Robót Turbinowych
Oddział Serwisu Technicznego Zamość
Zakład Kozienice:
Wydział Remontu Turbin
Wydział Remontu Kotłów
Wydział Wykonawstwa Instalacji
Wydział Remontów Cementowni
Wytwórnia Elementów Stalowych
Zakład Badań Technicznych, Diagnostyki i Kontroli Jakości:
Wydział Diagnostyki Materiałowej - Laboratorium
Wydział Diagnostyki Maszyn
Wydział Spawalnictwa
Wydział Kontroli Jakości Lublin
Wydział Kontroli Jakości Kozienice
